Изучение взаимодействия токсина VSTx1 из яда паука с потенциал-чувствительным доменом калиевого канала KvAP методами ямр-спектроскопии и молекулярного моделирования
1Московский физико-технический институт 2Институт биоорганической химии им. М.М. Шемякина и Ю.А. Овчинникова РАН 3Высшая школа экономики
Цель работы, изучение механизмов активации-инактивации потенциал-чувствительных ионных каналов и их взаимодействие с лигандами, методами ЯМР-спектросопии и молекулярного моделирования
1Саратовский государственный университет им. Н. Г. Чернышевского, Саратов
2Институт геохимии и аналитической химии им. В. И. Вернадского РАН, Москва
Показано, что взаимодействие молекулы-стержня с молекулами воды приводит к изменению её конформации и препятствует скольжению кольца ротаксана вдоль стержня. Разрыв водородной связи меняет конформацию молекулы-стержня, что позволяет кольцу перемещаться, меняя состояние системы с «выключено» на «включено»
Электронный спектр поглощения структурного элемента молекулярного переключателя М.Рида и Д.Тура
1Тен Г.Н., 1Уткин И.С, 1Саяпин К.А.,2Баранов В.И.
1Саратовский государственный университет им. Н. Г. Чернышевского, Саратов
2Институт геохимии и аналитической химии им. В. И. Вернадского РАН, Москва
В данной работе методом молекулярного моделирования определены геометрические параметры и электронный спектр поглощения структурного элемента бензол-1,4-дитиолата переключателя М. Рида и Д. Тура в основном состоянии
Влияние воды на структуру L-триптофана в 1Lb и 1La электронных состояниях
1Тен Г.Н., 2Щербакова Н.Е., 3Баранов В.И.
1Саратовский государственный университет им. Н. Г. Чернышевского, Саратов
2Российский научно-исследовательский противочумной институт «Микроб», Саратов
3Институт геохимии и аналитической химии им. В. И. Вернадского РАН, Москва
В данной работе определено влияние воды, расположенной между биполярными группами цвиттер-иона, на геометрические параметры Trp в 1Lb и 1La электронно-возбуждённых состояниях
Сравнение консервативности ключевых белков, участвующих в мейотическом сайленсинге хроматина, и практическое использование этих данных в иммуноцитохимических исследованиях
Гришаева Т.М.
ФГБУН Институт общей генетики им. Н.И. Вавилова РАН
Методами биоинформатики проанализированы некоторые параметры ключевых белков сайленсинга хроматина: SUMO1 (Small ubiquitin-related modifier 1, длина белка около 100 а.к.), ATR (серин-треониновая протеинкиназа, длина белка около 2600 а.к.) и гистона H2AX (длина 130-150 а.к.) у восьми модельных генетических видов от дрожжей до человека. Установлено, что наиболее консервативен гистон H2AX, довольно консервативен также белок SUMO1. Белки ATR сходны только в С-концевой части молекулы, составляющей около 1/3 её длины